docs: case05纵波 + case06横波一维原子链

- case05 Readme.md 更新为纵波模拟描述
- case05 run_dynamics.py 注释更新
- case06 创建为一维原子链横波模拟
  - coord.txt: fix_x=1, fix_y=1, fix_z=0 (z方向自由)
  - driver.txt: amp_z=0.5, freq_z=0.1, phi_z=90°
  - input.txt: 横波配置 + step_plot_wave
  - Readme.md + doc/index.html + run_dynamics.py
- 模拟验证通过 (50000步/30s)

examples/case05/Readme.md

@@ -1,6 +1,6 @@
-# case05: 一维原子链驱动力学模拟
+# case05: 一维原子链纵波模拟
 
-60 个原子沿 x 轴排列，相邻原子用弹簧连接。原子 1 受驱动力作用。
+60 个原子沿 x 轴排列，相邻原子用弹簧连接。原子 1 受 x 方向驱动力作用，产生沿链传播的纵波。
 
 ## 物理设定
 
@@ -8,12 +8,12 @@
 |---|---|
 | 原子数 | 60 |
 | 排列 | 沿 x 轴等间距排列，间距为 1 |
-| 约束 | 原子**只沿 z 方向**振动（fix_x=1, fix_y=1, fix_z=0） |
+| 约束 | 原子**沿 x 方向自由振动**（fix_x=0, fix_y=1, fix_z=1），y, z 锁定 |
 | 弹簧 | 劲度系数 k=1.0，原长 L₀=1.0 |
 | 重力 | 无 |
 | 万有引力 | 无 |
 | 阻尼 | 无 |
-| 驱动力 | 原子 1（详见 driver.txt） |
+| 驱动力 | 原子 1（x 方向驱动） |
 | 算法 | leapfrog（蛙跳法，能量守恒） |
 
 ## 驱动力
@@ -21,16 +21,14 @@
 原子 1 的位置由 `input/driver.txt` 中的驱动力公式决定：
 
 ```math
-z(t) = A_z \cdot \cos(2\pi f_z t + \phi_z)
+x(t) = A_x \cdot \cos(2\pi f_x t + \phi_x)
 ```
 
-当前参数：A_z = 5.0, f_z = 1.0 Hz, φ_z = 90°（全程驱动）。
-
-受驱原子完全忽略 coord.txt 中的初始坐标和 fix 约束，位置/速度由驱动力解析确定。
+当前参数：A_x = 0.5, f_x = 1.0 Hz, φ_x = 0°, period = all（全程驱动）。
 
 ## 动力学行为
 
-原子 1 的受迫振动通过弹簧逐次传递给相邻原子，形成沿链传播的横波。由于横向振动的几何非线性（弹簧张力主要在 x 方向），z 方向有效刚度低，波速较慢，呈现 FPU 型非线性动力学特征。
+原子 1 沿 x 方向的受迫振动通过弹簧逐次传递给相邻原子，形成沿链传播的**纵波**（压缩波/疏密波）。由于 x 方向的弹簧力是线性的（F ≈ k·Δx），纵波的传播速度较快，能量沿链高效传递。
 
 ## 使用方法
 

examples/case05/run_dynamics.py

@@ -1,5 +1,5 @@
 """
-Case runner for Dynamics case05 — 1D atomic chain.
+Case runner for Dynamics case05 — 1D atomic chain (longitudinal wave).
 
 This script keeps program and data separated:
   - program: ../../dynamics.py