docs: case05纵波 + case06横波一维原子链
- case05 Readme.md 更新为纵波模拟描述 - case05 run_dynamics.py 注释更新 - case06 创建为一维原子链横波模拟 - coord.txt: fix_x=1, fix_y=1, fix_z=0 (z方向自由) - driver.txt: amp_z=0.5, freq_z=0.1, phi_z=90° - input.txt: 横波配置 + step_plot_wave - Readme.md + doc/index.html + run_dynamics.py - 模拟验证通过 (50000步/30s)
This commit is contained in:
@@ -3,7 +3,7 @@
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<head>
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<meta charset="UTF-8">
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<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0">
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<title>case05 — 一维原子链驱动力学模拟 | 物理原理 & 使用文档</title>
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<title>case06 — 一维原子链驱动力学模拟 | 物理原理 & 使用文档</title>
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<style>
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:root {
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--bg: #f8f9fa;
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@@ -156,7 +156,7 @@
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<header class="hero">
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<h1>一维原子链驱动力学模拟</h1>
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<p class="subtitle">60 个原子沿 x 轴排列 · 弹簧连接 · z 方向受迫振动</p>
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<span class="badge">case05 · examples/case05</span>
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<span class="badge">case06 · examples/case06</span>
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</header>
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<div class="container">
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@@ -324,7 +324,7 @@
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<div class="card">
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<h3>4.1 完整运行（模拟 + 动画）</h3>
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<pre>cd examples/case05
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<pre>cd examples/case06
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python run_dynamics.py</pre>
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<p>这步会依次执行：物理模拟 → 抽帧 → 打开 VisPy 3D 动画窗口。</p>
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</div>
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@@ -356,9 +356,11 @@ step_animation: 1 # 播放动画</pre>
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<tr><th>操作</th><th>效果</th></tr>
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<tr><td>鼠标拖动</td><td>旋转视角</td></tr>
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<tr><td>滚轮</td><td>缩放</td></tr>
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<tr><td>A / D 键</td><td>视角向左 / 向右平移</td></tr>
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<tr><td>W / S 键</td><td>视角向上 / 向下平移</td></tr>
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<tr><td>Q / E 键</td><td>降低 / 提高平移速度</td></tr>
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<tr><td>W / S 键</td><td>相机沿 Z 轴向前 / 向后移动（靠近/远离场景）</td></tr>
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<tr><td>A / D 键</td><td>视角向右 / 向左平移</td></tr>
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<tr><td>E / Q 键</td><td>视角上升 / 下降（屏幕方向）</td></tr>
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<tr><td>C / X 键</td><td>增大 / 减小步长</td></tr>
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<tr><td>V 键</td><td>切换透视 / 正交投影</td></tr>
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<tr><td>左上角 <strong>reset</strong> 按钮</td><td>复位视角到初始位置</td></tr>
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<tr><td>左上角 <strong>info</strong> 按钮</td><td>切换信息面板显示/隐藏</td></tr>
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<tr><td>左上角 <strong>axes</strong> 按钮</td><td>切换坐标轴显示/隐藏</td></tr>
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@@ -397,6 +399,7 @@ step_animation: 1 # 播放动画</pre>
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<tr><td>step_simulate</td><td>跳过模拟（加载已有轨迹）</td><td>运行物理模拟</td></tr>
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<tr><td>step_sample</td><td>跳过抽帧</td><td>从轨迹抽取显示帧</td></tr>
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<tr><td>step_plot</td><td>不生成图表</td><td>生成轨迹/能量图</td></tr>
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<tr><td><strong>step_plot_wave</strong></td><td>不生成波形图</td><td>生成波形能量动画 GIF</td></tr>
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<tr><td>step_animation</td><td>不启动动画</td><td>自动打开 VisPy 3D 窗口</td></tr>
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<tr><td>force_calc</td><td>自动检测缓存</td><td>强制重新计算</td></tr>
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</table>
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@@ -409,7 +412,7 @@ step_animation: 1 # 播放动画</pre>
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<section id="files">
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<h2>六、文件结构</h2>
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<pre>case05/
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<pre>case06/
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├── input/
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│ ├── input.txt # 主配置文件（YAML 格式）
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│ ├── coord.txt # 原子坐标（60 个原子）
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@@ -420,7 +423,8 @@ step_animation: 1 # 播放动画</pre>
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│ ├── trajectory.txt # 全量轨迹数据（10000 步 × 60 原子）
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│ ├── display.txt # 抽帧后的动画数据（200 帧 × 60 原子）
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│ ├── dynamics.log # 计算日志
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│ └── animation.log # 动画启动日志（闪退时排查用）
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│ ├── animation.log # 动画启动日志（闪退时排查用）
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│ └── wave_animation.gif # 波形能量动画（step_plot_wave=1 时生成）
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├── doc/
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│ └── index.html # <span class="cm">本文档</span>
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├── Readme.md # 案例简介
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