feat: 真蛙跳法重构（Python/C/C++/Fortran 四引擎统一）

- 新增 compute_accel_conservative / accel_conservative：
  保守力加速度（弹簧+重力+原子间引力），不含阻尼，供蛙跳专用
- 重写 leapfrog_step / leapfrog_full：
  - 无阻尼：纯辛积分器，每步 1 次力计算（原 Velocity-Verlet 需 2 次）
  - 有阻尼：半隐式处理 v(t+dt/2)=[v(t-dt/2)*(1-α)+a_c*dt]/(1+α)，无条件稳定
- 主循环加初始化反向半步 v(-dt/2)=v(0)-0.5*a_c(0)*dt
- 修复 C/C++ number of frames 字段写采样帧数而非总积分步数的 bug
- Python 引擎：新增 display.npz 二进制格式，draw.py/plot_wave.py 优先读取
- 编译参数统一为 -O3 -march=native -ffast-math

examples/case06/input/bond.txt

@@ -1,2 +1,2 @@
 bond_name k rest_length
-k1 10.0 1.0
+k1 50.0 1.0

examples/case06/input/driver.txt

@@ -1,2 +1,2 @@
 n amp_x amp_y amp_z freq_x freq_y freq_z phi_x phi_y phi_z period
-1     0     0   2.0      0      0    0.1     0     0    90    all
+1     0     0   2.0      0      0   0.05     0     0    90    all

examples/case06/input/input.txt

@@ -19,7 +19,7 @@ save_trajectory: 0  # 0=不保留完整轨迹文件, 1=保留 trajectory.txt（
 
 # ── 计算引擎 ──────────────────────────────────
 # 可选: python, c, cpp, fortran, java
-engine: c  # 默认使用 python 引擎
+engine: python  # 默认使用 python 引擎
 
 # ── 盒子 ──────────────────────────────────────
 box_a: 80.0         # 立方体半边长，粒子被限制在 [-box_a, box_a]³ 内
@@ -69,10 +69,10 @@ warmup_steps: 0           # 默认 0（立即开始记录）
 T_total:  100.0
 
 # 抽帧间隔（每 NSTEP 步取一帧用于动画）
-NSTEP: 100
+NSTEP: 10
 
 # ── 时间步长 ──────────────────────────────────
-DT:    0.001         # 时间步长 (s)
+DT:    0.01         # 时间步长 (s)
 
 # 抽帧范围：只保存 [sample_start, sample_end) 区间内的帧
 sample_start: null        # null 表示从头开始（帧索引从 0 起）

examples/case06/run_dynamics.py

@@ -31,7 +31,7 @@ def load_dynamics_module(module_path: Path):
 
 
 def main():
-    parser = argparse.ArgumentParser(description="运行 Dynamics 示例案例 case01")
+    parser = argparse.ArgumentParser(description="运行 Dynamics 示例案例 case06")
     parser.add_argument("--no-plot", action="store_true", help="跳过 matplotlib 绘图")
     args = parser.parse_args()