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- 新增 compute_accel_conservative / accel_conservative： 保守力加速度（弹簧+重力+原子间引力），不含阻尼，供蛙跳专用 - 重写 leapfrog_step / leapfrog_full： - 无阻尼：纯辛积分器，每步 1 次力计算（原 Velocity-Verlet 需 2 次） - 有阻尼：半隐式处理 v(t+dt/2)=[v(t-dt/2)*(1-α)+a_c*dt]/(1+α)，无条件稳定 - 主循环加初始化反向半步 v(-dt/2)=v(0)-0.5*a_c(0)*dt - 修复 C/C++ number of frames 字段写采样帧数而非总积分步数的 bug - Python 引擎：新增 display.npz 二进制格式，draw.py/plot_wave.py 优先读取 - 编译参数统一为 -O3 -march=native -ffast-math
case06: 一维原子链横波模拟
60 个原子沿 x 轴排列，相邻原子用弹簧连接。原子 1 受 z 方向驱动力作用，产生沿链传播的横波。
物理设定
| 参数 | 值 |
|---|---|
| 原子数 | 120 |
| 排列 | 沿 x 轴等间距排列，间距为 1 |
| 约束 | 原子沿 z 方向自由振动（fix_x=1, fix_y=1, fix_z=0），x, y 锁定 |
| 弹簧 | 劲度系数 k=1.0，原长 L₀=1.0 |
| 重力 | 无 |
| 万有引力 | 无 |
| 阻尼 | 无 |
| 驱动力 | 原子 1（z 方向驱动） |
| 算法 | leapfrog（蛙跳法，能量守恒） |
驱动力
原子 1 的位置由 input/driver.txt 中的驱动力公式决定：
z(t) = A_z \cdot \cos(2\pi f_z t + \phi_z)
当前参数：A_z = 0.5, f_z = 0.1 Hz, φ_z = 90°, period = all（全程驱动）。
动力学行为
原子 1 沿 z 方向的受迫振动通过弹簧逐次传递给相邻原子，形成沿链传播的横波。由于 z 方向的振动是横向的，弹簧大部分张力在 x 方向，z 方向的有效刚度是非线性的——等效于一个三次方恢复力（FPU 型非线性），因此波速较慢。
使用方法
cd examples/case06
python run_dynamics.py
配置参数详见 input/input.txt，驱动力定义见 input/driver.txt，完整文档见 doc/index.html。